Promjena boje urina može ukazati na zdravstvene probleme. Tako ružičasto-crvenu boju mokraće mogu uzrokovati neke namirnice, ali i bubrežna insuficijencija. Svijetložutu i zlatno žutu boju ima normalna mokraća.

Boja limuna karakteristična je za razrijeđenu mokraću pri izlučivanju velikih količina urina. U tim slučajevima, količina mokraće veća je zbog veće količine tekućine koja se popije.

Intenzivna žuta boja često je uzrokovana uzimanjem lijekova protiv crijevnih nametnika, antibakterijskih lijekova u liječenju infekcija mokraćnih putova ili zbog uzimanja riboflavina - vitamina B2.

Žuto-narančasta boja karakteristična je za koncentriranu mokraću pri izlučivanju smanjenih količina urina. Količina izlučene mokraće u tim je slučajevima manja od normalne zbog povećanog znojenja, povišene tjelesne temperature ili dehidriranosti izazvane povraćanjem ili proljevom.

Ružičasto-crvenu boju mokraće mogu uzrokovati neke namirnice (cvekla, borovnica, neke vrste gljiva) ili slatkiši koji sadrže anilin. Međutim, tako će mokraću obojiti i krv tj. hemoglobin (boja crvenih krvnih stanica) ili mioglobin (pigment mišićnog tkiva). Uzrok može biti i prevelika koncentracija urata odnosno mokraćne kiseline koja potiče iz hrane (iznutrice, meso, riba), bubrežna insuficijencija ili giht.

Smeđe-jantarna boja može biti znak povećane količine bilirubina u krvi i mokraći, na primjer zbog ciroze jetre, zastoja žuči ili zbog virusnog hepatitisa.

Tamnosmeđa boja može biti posljedica postojanja jedne vrste patološkog derivata hemoglobina koji nastaje zbog urođene metaboličke greške ili stečene, izazvane nekim hemijskim tvarima među kojima su neki analgetici i protuupalni lijekovi.